時為明治64年。  舞台為德川慶喜始終掌握絕對權力的另一個日本。國家擁有獨有的能源“龍脈”，實現了江戶時代與科學世界相互交融的獨特發展狀態。  然而，在繁榮的都市背後，反体制派组织クチナワ蠢蠢欲动，点燃革命的火焰，企图推翻政权。 为了能够消灭他们，德川政府设立的暗组织“鵺”。  幼時家人被殺害的雪村咲羽，成為了“鵺”的處刑人，持續尋找著他的仇人蛇埜目。